Cuando el coronel antimutante William Stryker lleva a cabo un ataque contra la escuela del Profesor X y secuestra al propio profesor, los X-Men se enfrentan a una situación de emergencia. Con su líder desaparecido y su hogar bajo amenaza, el equipo se ve obligado a tomar medidas drásticas. A pesar de sus diferencias históricas y su enemistad previa, los X-Men deciden aliarse con Magneto, su antiguo archienemigo y líder de la Hermandad de mutantes supremacistas.

Esta alianza inusual se forma por la necesidad urgente de detener a Stryker, cuyos planes amenazan tanto a mutantes como a humanos por igual. Aunque Magneto tiene motivaciones egoístas y una visión radicalmente diferente de cómo debería ser el futuro de los mutantes, él y los X-Men encuentran un terreno común en la urgencia de proteger a su gente y detener una amenaza común.

Juntos, los X-Men y Magneto enfrentan a Stryker y su organización, utilizando sus habilidades y recursos para desbaratar sus planes y liberar al Profesor X. Esta alianza tensa y complicada demuestra que, en tiempos de crisis, incluso los enemigos más acérrimos pueden unirse por un bien mayor, aunque las consecuencias y las tensiones internas no se resuelvan fácilmente.