Mientras investiga al misterioso culto del "Loto Blanco" y sus planes de rebelión contra el Shogunato, Rikka Isurugi —líder del Clan Fox— cruza su camino con Okyo, una implacable ninja Fuma enviada por el propio Shogun. Sin embargo, la investigación da un vuelco letal cuando ambas convergen frente a un enemigo común: el temible clan Iga, comandado por Hattori Hanzo, un guerrero consumido por un profundo deseo de venganza contra la familia Tokugawa. Así, un brutal conflicto de tres bandos está a punto de estallar, poniendo a prueba la lealtad y el acero de las facciones más letales de las sombras.