Mahito, un adolescente devastado por la muerte de su madre durante la Segunda Guerra Mundial, es llevado desde Tokio a la tranquila casa rural de su nueva madrastra, Natsuko, quien sorprendentemente se asemeja mucho a su difunta madre. En este entorno nuevo y extraño, Mahito lucha por adaptarse mientras lidia con la presencia inquietante de una garza real persistente que lo llama «el tan esperado». Esta situación desconcertante profundiza la confusión y tormento emocional de Mahito, quien se ve obligado a confrontar tanto sus pérdidas pasadas como las desconcertantes señales del presente en este ambiente marcado por la guerra y la misteriosa presencia aviar.